Музей ёш булишига карамасдан бир канча
халкаро ташкилотлар ва чет эл университетлари билан якиндан
илмий-маьрифий алокаларни йулга куйган. Масалан музей ходимларидан
Б.Мамадиев ЮНЕСКОнинг Осиё ва тинч океани минтакаси булими жойлашган
Япониянинг Нара шахрида маданий меросни асраш масаласида малака ошириб
келган.
Н.Хушвактов Франциянинг Бордо-3 Университетида маданий
меросни асраш ва тиклаш масаласидаги Еврокомиссия молиялаштираётган
халкаро грант иштирокчиси сифатида малака ошириб келган. Музей
Италиянинг Калтажироне (Сицилия вилояти) шахридаги Сопол музейи билан
якиндан олока килиб келади.
Музей ходимларидан Н.Хушвактов
Франция, Польша ва Узбекистон Республикаларининг халкаро экспедициясида
Кизилкумдаги неолит даври ёдгорликларини урганиш буйича экспедициясида
иштирок этиб келмокда. Музейда тез-тез халкаро ва Республика
микёсидаги улмий конференция ва семинарлар ташкил этилади. 2007-йилда
Козогистон Республикасининг «Дашти-Арт маркази» (Караганда шахри),
Узбекистон Республикаси Маданият ва спорт ишлари вазирлиги ташаббуси
билан Узбекистон ва Кораколпогистон музейлари ходимларининг семинари
булиб утди.